Das Klischee ist ja auch nur sehr bedingt wahr, da geb ich Dir recht.
Zu der Stufe der NSC könnte man sich sicherlich lang und breit austauschen - auf der anderen Seite ist bspw. Alusair auch relativ niedrigstufig für die VR, und trotzdem die Regentin Cormyrs, wenn auch mit Hilfe.
Die Frage: "Wieso sind die SCs nicht die Führer" stellt sich meines Erachtens aber überhaupt nicht. Persönliche Macht hat nur begrenzt mit politischer Macht zu tun. Tatsache ist jawohl das die SCs nicht Bestandteil der Welt sind, wie sie im Buch steht - zu dem Zeitpunkt, wo sie Bestandteil dieser Welt werden, kann sich auch einiges ändern.
Es wird aber etliche Stufen dauern, bis sich diese Frage überhaupt stellt. Jedenfalls ist eines klar. SCs mittlerer Stufen (so ab Stufe 6-7) sind schon etwas besonderes, und um Stufe 10 wohl echte Helden, denen wenige das Wasser reichen können.
Eberron hält mit Sicherheit Herausforderungen für hochstufige Gruppen parat. Aber diese können auch nur die Helden selbst bewältigen, und sonst kaum jemand.
Hier wird kein Khelben oder Elminster kommen, und den Tag retten (und seien wir mal ehrlich - wenn die Frage, wieso Elminster permanent anderweitig beschäftigt ist, so oft gestellt wird, ist sie wohl nicht aus der Luft gegriffen). Schaut man sich bspw. die Return of the Archwizards Trilogy an, kann man mal wieder prima sehen, wer da wirklich die Hosen an hat.
Das gleiche Problem hat auch CotSQ, denn auch das spielt mit der Glaubwürdigkeit. Schaut man sich mal an, was am Ende passiert, wenn die SCs NICHT eingreifen (Tausende Tote, 3 der Täler werden nahezu entvölkert), ist es doch schon sehr merkwürdig... denn es GIBT ja genug NSCs, die das Potential hätten, einzugreifen. Tun sie es nicht, kann man sich dann mal wieder fragen, welche anderen Bedrohungen da gerwade wieder in Faerûn wüten. Tun sie es, sind die SCs nicht die Helden.
Der selbe Plot in Eberron wäre einfach so unbedingt von den SCs abhängig, dass Erfolg oder Misserfolg einen ganz anderen Beigeschmack hätten.